Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Riox1Q9JJF3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms