Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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