Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hmg20aQ9DC33 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hmg20aQ9DC33 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hmg20aQ9DC33 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hmg20aQ9DC33 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hmg20aQ9DC33 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmg20aQ9DC33 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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