Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms