Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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