Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms