Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms