Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms