Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms