Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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