Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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