Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms