Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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