Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms