Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis12Q9CY25 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms