Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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