Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms