Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rdm1Q9CQK3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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