Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms