Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms