Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup155Q99P88 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup155Q99P88 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms