Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b1Q99NB9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms