Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Higd1bQ99JY6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms