Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms