Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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