Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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