Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Afg3l1Q920A7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1Q920A7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Afg3l1Q920A7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1Q920A7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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