Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms