Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms