Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thoc3Q8VE80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thoc3Q8VE80 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thoc3Q8VE80 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thoc3Q8VE80 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms