Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc39cQ8VE09 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc39cQ8VE09 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms