Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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