Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms