Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms