Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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