Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms