Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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