Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms