Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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