Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp27Q8CEG8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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