Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms