Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SynpoQ8CC35 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SynpoQ8CC35 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms