Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chic1Q8CBW7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chic1Q8CBW7 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chic1Q8CBW7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms