Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms