Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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