Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf187Q8BFX1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms