Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Amigo1Q80ZD8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Amigo1Q80ZD8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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