Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ell3Q80VR2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms