Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc29Q80VM3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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