Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Clec18aQ7TSQ1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Clec18aQ7TSQ1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Clec18aQ7TSQ1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Clec18aQ7TSQ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Clec18aQ7TSQ1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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