Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms